El Centro Científico Tecnológico Región de Antofagasta CICITEM se origina en el marco del Programa Regional de Investigación Científica y Tecnológica de CONICYT para crear centros regionales de ciencia y tecnología, comenzando oficialmente sus operaciones el año 2006. 

CICITEM nace bajo la figura de corporación de derecho privado sin fines de lucro con sentido de lo público, obteniendo su personalidad jurídica el 5 de mayo del 2008, mediante la Res. Ex. 1694, con la finalidad de descentralizar la ciencia y generar innovación y tecnología a nivel regional.